O Unibanco é controlado pela Unibanco Holdings, que detém uma participação de 59,2% do capital total do grupo financeiro. Essa estrutura, criada em 1994, permitiu ao banco alavancar capitalizações relevantes para seu crescimento e viabilizar aquisições. Os dividendos por ação das duas empresas são praticamente idênticos, graças à conjugação de três fatores: o número de ações que perfazem o capital da Holdings é igual ao número de ações do Unibanco possuídas pela Holdings; os dividendos recebidos do Unibanco são a única fonte de caixa da Holdings; e, finalmente, a Holdings distribui 100% dos dividendos que recebe após a formação de reservas legais (veja "Política de dividendos", no capítulo Ações do Unibanco e da Unibanco Holdings).